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https://repositorio.ifs.edu.br/biblioteca/handle/123456789/1258
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Campo DC | Valor | Idioma |
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dc.date.accessioned | 2020-07-01T14:52:27Z | - |
dc.date.available | 2020-07-01T14:52:27Z | - |
dc.date.issued | 2015 | - |
dc.identifier.citation | OLIVEIRA, Ana Catarina Lima de et al. Flow cytometry reliability analysis and variations in sugarcane DNA content. Genetics and molecular research. v. 14, n. 2, p. 7172-7183, 2015 | pt_BR |
dc.identifier.issn | 1676-5680 | - |
dc.identifier.uri | https://repositorio.ifs.edu.br/biblioteca/handle/123456789/1258 | - |
dc.description.abstract | The aim of this study was to evaluate the reliability of flow cytometry analysis and the use of this technique to differentiate species and varieties of sugarcane (Saccharum spp) according to their relative DNA content. We analyzed 16 varieties and three species belonging to this genus. To determine a reliable protocol, we evaluated three extraction buffers (LB01, Marie, and Tris·MgCl2), the presence and absence of RNase, six doses of propidium iodide (10, 15, 20, 25, and 30 μg), four periods of exposure to propidium iodide (0, 5, 10, and 20 min), and seven external reference standards (peas, beans, corn, radish, rye, soybean, and tomato) with reference to the coefficient of variation and the DNA content. For statistical analyses, we used the programs Sisvar(®) and Xlstat(®). We recommend using the Marie extraction buffer and at least 15 μg propidium iodide. The samples should not be analyzed immediately after the addition of propidium iodide. The use of RNase is optional, and tomato should be used as an external reference standard. The results show that sugarcane has a variable genome size (8.42 to 12.12 pg/2C) and the individuals analyzed could be separated into four groups according to their DNA content with relative equality in the genome sizes of the commercial varieties. | pt_BR |
dc.description.sponsorship | Genetics and molecular research - GMR | en |
dc.language.iso | pt_BR | pt_BR |
dc.publisher | Fundação de Pesquisas Científicas de Ribeirão Preto – FUNPEC-RP | pt_BR |
dc.subject | Agronomia | pt_BR |
dc.subject | Citometria de fluxo | pt_BR |
dc.subject | Saccharum spp | pt_BR |
dc.subject | Cana de açúcar | pt_BR |
dc.subject | Fitotecnia | pt_BR |
dc.subject | DNA | pt_BR |
dc.subject | Flow cytometry | en |
dc.subject | Phytotechnics | en |
dc.subject | Agronomy | en |
dc.subject | Sugar cane | en |
dc.title | Flow cytometry reliability analysis and variations in sugarcane DNA content | en |
dc.title.alternative | Análise da confiabilidade da citometria de fluxo e variações no conteúdo de DNA da cana-de-açúcar | pt_BR |
dc.type | Artigo | pt_BR |
dc.contributor.author | Oliveira, Ana Catarina Lima de | - |
dc.contributor.author | Pasqual, Moacir | - |
dc.contributor.author | Bruzi, Adriano Teodoro | - |
dc.contributor.author | Pio, Leila Aparecida Salles | - |
dc.contributor.author | Mendonça, Paula Maria de Souza | - |
dc.contributor.author | Soares, Joyce Dória Rodrigues | - |
dc.contributor | Machado, Ana Catarina Lima de Oliveira | - |
dc.description.abstract2 | O objetivo deste estudo foi avaliar a confiabilidade da análise por citometria de fluxo e o uso dessa técnica para diferenciar espécies e variedades de cana-de-açúcar (Saccharum spp) de acordo com seu conteúdo relativo de DNA. Foram analisadas 16 variedades e três espécies pertencentes a esse gênero. Para determinar um protocolo confiável, avaliamos três tampões de extração (LB01, Marie e Tris · MgCl2), presença e ausência de RNase, seis doses de iodeto de propídio (10, 15, 20, 25 e 30 μg), quatro períodos de exposição ao iodeto de propídio (0, 5, 10 e 20 min) e sete padrões de referência externos (ervilhas, feijões, milho, rabanete, centeio, soja e tomate) com referência ao coeficiente de variação e ao conteúdo de DNA. Para análises estatísticas, foram utilizados os programas Sisvar (®) e Xlstat (®). Recomendamos o uso do tampão de extração Marie e pelo menos 15 μg de iodeto de propídio. As amostras não devem ser analisadas imediatamente após a adição de iodeto de propídio. O uso da RNase é opcional e o tomate deve ser usado como padrão de referência externo. Os resultados mostram que a cana-de-açúcar possui um tamanho variável de genoma (8,42 a 12,12 pg / 2C) e os indivíduos analisados podem ser separados em quatro grupos, de acordo com o conteúdo de DNA, com relativa igualdade no tamanho do genoma das variedades comerciais. | pt_BR |
Aparece nas coleções: | Artigo, Resumo científico e Comunicação em eventos - Agroecologia |
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Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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Flow cytometry reliability analysis and variations in sugarcane DNA content.pdf | 1,15 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |
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